Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCN5AQ14524 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN5AQ14524 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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