Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCINQ13939 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCINQ13939 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCINQ13939 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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CCINQ13939 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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CCINQ13939 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCINQ13939 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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CCINQ13939 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCINQ13939 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCINQ13939 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCINQ13939 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCINQ13939 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCINQ13939 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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