Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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GTF2H3Q13889 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GTF2H3Q13889 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GTF2H3Q13889 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GTF2H3Q13889 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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