Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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