Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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