Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HTR4Q13639 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR4Q13639 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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