Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSTA3Q13630 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms