Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPM6BQ13491 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPM6BQ13491 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms