Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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