Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
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