Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP4Q13115 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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