Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAF1Q13077 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF1Q13077 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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