Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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