Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRDNQ13061 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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