Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK3Q13003 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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