Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms