Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRJQ12913 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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