Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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