Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TROQ12816 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
TROQ12816 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TROQ12816 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TROQ12816 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TROQ12816 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TROQ12816 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TROQ12816 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TROQ12816 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TROQ12816 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TROQ12816 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TROQ12816 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TROQ12816 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TROQ12816 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TROQ12816 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TROQ12816 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TROQ12816 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TROQ12816 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TROQ12816 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TROQ12816 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TROQ12816 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TROQ12816 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TROQ12816 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TROQ12816 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TROQ12816 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
TROQ12816 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
TROQ12816 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TROQ12816 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TROQ12816 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TROQ12816 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TROQ12816 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TROQ12816 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TROQ12816 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TROQ12816 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TROQ12816 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TROQ12816 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TROQ12816 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TROQ12816 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TROQ12816 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TROQ12816 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TROQ12816 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
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