Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMA1Q12791 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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