Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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