Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 OAF3YKR064W 2592 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 CAF130YGR134W 3369 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 AI4Q0065 1671 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 CCT7YJL111W 1653 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 GTR2YGR163W 1026 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YIL161WYIL161W 708 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YJR111CYJR111C 852 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 CCE1YKL011C 1062 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 RCN1YKL159C 636 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 HNT3YOR258W 654 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 CUP9YPL177C 921 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 PBP2YBR233W 1242 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YBR300CYBR300C 498 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 PHO5YBR093C 1404 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 DBP7YKR024C 2229 nt3.4□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 MIG1YGL035C 1515 nt3.4□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YDR042CYDR042C 603 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 PET100YDR079W 336 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RGI1YER067W 486 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YGR064WYGR064W 369 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 THP2YHR167W 786 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 LSM1YJL124C 519 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 NDL1YLR254C 570 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 PHO88YBR106W 567 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 STT4YLR305C 5703 nt3.4□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RIM1YCR028C-A 408 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RPL13AYDL082W 600 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 PDS1YDR113C 1122 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 PEX10YDR265W 1014 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 PMI40YER003C 1290 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 STE2YFL026W 1296 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 IRC18YJL037W 675 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YKL222CYKL222C 2118 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 NBP1YLR457C 960 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 CSI1YMR025W 888 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 GRX7YBR014C 612 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 ARL3YPL051W 597 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 snR42snR42 351 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 CDC20YGL116W 1833 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 GYP7YDL234C 2241 nt3.39□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 ESC2YDR363W 1371 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 BEM4YPL161C 1902 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 DPP1YDR284C 870 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YDR509WYDR509W 348 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 GPP2YER062C 753 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 PNC1YGL037C 651 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 AML1YGR001C 747 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 PPX1YHR201C 1194 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 CFD1YIL003W 882 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RPL6AYML073C 531 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YNR025CYNR025C 360 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 SME1YOR159C 285 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 MCA1YOR197W 1299 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 SPR2YOR214C 711 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 MGE1YOR232W 687 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YPL035CYPL035C 348 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 SLM2YNL047C 1971 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 SRB8YCR081W 4284 nt3.38□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 FUN30YAL019W 3396 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RPS29BYDL061C 171 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YGR114CYGR114C 390 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 CTK2YJL006C 972 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RPS22AYJL190C 393 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YMR141CYMR141C 309 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 PEX15YOL044W 1152 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 ILS1YBL076C 3219 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 SRC1YML034W 2505 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RTT10YPL183C 3042 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 ESL1YIL151C 3357 nt3.37□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 BUD4YJR092W 4344 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 SEC27YGL137W 2670 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 ATG27YJL178C 816 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 GPX1YKL026C 504 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YPT6YLR262C 648 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RPL13BYMR142C 600 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YBL055CYBL055C 1257 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 IZH2YOL002C 954 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YOR152CYOR152C 771 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YGR067CYGR067C 2415 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 GCD2YGR083C 1956 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 TSC11YER093C 4293 nt3.36□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 TCB2YNL087W 3537 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 LCB4YOR171C 1875 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 FAA2YER015W 2235 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YDL162CYDL162C 357 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 TLG1YDR468C 675 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YDR491CYDR491C 492 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 PTI1YGR156W 1278 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YLR271WYLR271W 825 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 MCT1YOR221C 1083 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RRG7YOR305W 729 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YPR153WYPR153W 423 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 TLC1TLC1 1301 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 TIF4631YGR162W 2859 nt3.35□□□□□ -1.87
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