Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YOR385WYOR385W 873 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 TFC4YGR047C 3078 nt2.42□□□□□ -2.02
USB1Q12208 MUS81YDR386W 1899 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 NMA111YNL123W 2994 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 PKP2YGL059W 1476 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RRT13YER066W 558 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 NSA2YER126C 786 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 SAY1YGR263C 1275 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RPL17BYJL177W 555 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 YNR068CYNR068C 819 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 SWD3YBR175W 948 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 BCK1YJL095W 4437 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 VHR2YER064C 1518 nt2.41□□□□□ -2.02
USB1Q12208 MON1YGL124C 1935 nt2.4□□□□□ -2.02
USB1Q12208 KIN82YCR091W 2163 nt2.4□□□□□ -2.02
USB1Q12208 SAP1YER047C 2694 nt2.4□□□□□ -2.02
USB1Q12208 BNA4YBL098W 1383 nt2.4□□□□□ -2.02
USB1Q12208 PEX6YNL329C 3093 nt2.4□□□□□ -2.03
USB1Q12208 DDI2YFL061W 678 nt2.4□□□□□ -2.03
USB1Q12208 TCD1YHR003C 1290 nt2.4□□□□□ -2.03
USB1Q12208 RPL27AYHR010W 411 nt2.4□□□□□ -2.03
USB1Q12208 ATG27YJL178C 816 nt2.4□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.4□□□□□ -2.03
USB1Q12208 RDS2YPL133C 1341 nt2.4□□□□□ -2.03
USB1Q12208 RSM23YGL129C 1353 nt2.39□□□□□ -2.03
USB1Q12208 SWR1YDR334W 4545 nt2.39□□□□□ -2.03
USB1Q12208 RDI1YDL135C 609 nt2.39□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YGL118CYGL118C 438 nt2.39□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YGR073CYGR073C 372 nt2.39□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YHR097CYHR097C 1101 nt2.39□□□□□ -2.03
USB1Q12208 MRPL6YHR147C 645 nt2.39□□□□□ -2.03
USB1Q12208 EBP2YKL172W 1284 nt2.39□□□□□ -2.03
USB1Q12208 PBS2YJL128C 2007 nt2.39□□□□□ -2.03
USB1Q12208 SKO1YNL167C 1944 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 NUM1YDR150W 8247 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YGR067CYGR067C 2415 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 PLM2YDR501W 1566 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 PRP18YGR006W 756 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YIL174WYIL174W 228 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 MRPL38YKL170W 417 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YLR290CYLR290C 834 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 MRPL33YMR286W 261 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 TEX1YNL253W 1269 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 INO4YOL108C 456 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 PIN3YPR154W 648 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YDR239CYDR239C 2364 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 ATP22YDR350C 2055 nt2.38□□□□□ -2.03
USB1Q12208 ORC1YML065W 2745 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 NHP10YDL002C 612 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 IZH1YDR492W 951 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 RTT105YER104W 627 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 SMX2YFL017W-A 234 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YGR064WYGR064W 369 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 DID4YKL002W 699 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 TFA2YKR062W 987 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 USB1YLR132C 873 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 VMA6YLR447C 1038 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 SPO20YMR017W 1194 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YNL043CYNL043C 321 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 COS1YNL336W 1146 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 ATG34YOL083W 1239 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 MSN1YOL116W 1149 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 PPT2YPL148C 522 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 RPO41YFL036W 4056 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 ICR1ICR1 3199 nt2.37□□□□□ -2.03
USB1Q12208 INP52YNL106C 3552 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 SPH1YLR313C 1593 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YDR535CYDR535C 501 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 RPB9YGL070C 369 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 POP6YGR030C 477 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YIL054WYIL054W 318 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 DCG1YIR030C 735 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 GPI14YJR013W 1212 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 LSM8YJR022W 330 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 SIC1YLR079W 855 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YLR400WYLR400W 474 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 GLO1YML004C 981 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 ERV41YML067C 1059 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 MPP6YNR024W 561 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 RRD2YPL152W 1077 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YPR142CYPR142C 564 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 POL30YBR088C 777 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 APD1YBR151W 951 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YLR278CYLR278C 4026 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YHR078WYHR078W 1659 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 IRC3YDR332W 2070 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 GEA1YJR031C 4227 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 MSB2YGR014W 3921 nt2.36□□□□□ -2.03
USB1Q12208 CWH41YGL027C 2502 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 CET1YPL228W 1650 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 HMO1YDR174W 741 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 PNC1YGL037C 651 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 TAN1YGL232W 870 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YGR190CYGR190C 366 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 TDA8YAL064C-A 381 nt2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.1 ms