Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 CHS1YNL192W 3396 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 RSM25YIL093C 795 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 YLL047WYLL047W 384 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 MUD1YBR119W 897 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 YJL181WYJL181W 1836 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 PIB1YDR313C 861 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 SEC28YIL076W 891 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 IML1YJR138W 4755 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 KOG1YHR186C 4674 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 YOS1YER074W-A 258 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 YFR045WYFR045W 930 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 PAI3YMR174C 207 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 POC4YPL144W 447 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 DSL1YNL258C 2265 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 SNX41YDR425W 1878 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 PEX10YDR265W 1014 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 RTS3YGR161C 792 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 IKI1YHR187W 930 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 SSU72YNL222W 621 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 YGR130CYGR130C 2451 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 TVP15YDR100W 432 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 PEX11YOL147C 711 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 ARO7YPR060C 771 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 VPS8YAL002W 3825 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 YML096WYML096W 1578 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1B-BRQ12193 YMR141CYMR141C 309 nt2.59□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 ECM13YBL043W 774 nt2.59□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 PSD2YGR170W 3417 nt2.58□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 YDL242WYDL242W 354 nt2.58□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 CAB2YIL083C 1098 nt2.58□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 ATG29YPL166W 642 nt2.58□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 APL2YKL135C 2181 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 GCD7YLR291C 1146 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 PDR17YNL264C 1053 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 BTS1YPL069C 1008 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 TFA1YKL028W 1449 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 MGA2YIR033W 3342 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 MET6YER091C 2304 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 YDR239CYDR239C 2364 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 VPS16YPL045W 2397 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 AIM39YOL053W 1188 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 SEC7YDR170C 6030 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 LRE1YCL051W 1752 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 YKL075CYKL075C 1353 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 YDR203WYDR203W 318 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 ERV29YGR284C 933 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 YJR111CYJR111C 852 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 NET1YJL076W 3570 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 SMI1YGR229C 1518 nt2.55□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 CSI1YMR025W 888 nt2.55□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 SMC1YFL008W 3678 nt2.55□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 YNL144CYNL144C 2223 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 RTT102YGR275W 474 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 YML090WYML090W 387 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 CDC31YOR257W 486 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 HAT1YPL001W 1125 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 YOR365CYOR365C 2112 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 GGA1YDR358W 1674 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 VMA8YEL051W 771 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 TMA22YJR014W 597 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 MRPL17YNL252C 846 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 IMH1YLR309C 2736 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 BUD6YLR319C 2367 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 YFH1YDL120W 525 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 SDT1YGL224C 843 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 MRPS17YMR188C 714 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-BRQ12193 POL2YNL262W 6669 nt2.53□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 HDA2YDR295C 2025 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 RTP1YMR185W 2946 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 YJL028WYJL028W 336 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 CWC24YLR323C 780 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 KRE2YDR483W 1329 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 PAC1YOR269W 1485 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 YOL079WYOL079W 399 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 ATG32YIL146C 1590 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 ROY1YMR258C 1662 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 NOP6YDL213C 678 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 CPR8YNR028W 927 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 GEA1YJR031C 4227 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 PHS1YJL097W 654 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 CAP1YKL007W 807 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 PZF1YPR186C 1290 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 ARL1YBR164C 552 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 SEC16YPL085W 6588 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 ALG1YBR110W 1350 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 CDC60YPL160W 3273 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 SOK2YMR016C 2358 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 TOP1YOL006C 2310 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 NRP1YDL167C 2160 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 MSH5YDL154W 2706 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 IRC10YOL015W 1761 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 COG4YPR105C 2586 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 CPA2YJR109C 3357 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 YPR203WYPR203W 309 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 MOT1YPL082C 5604 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 YPR1YDR368W 939 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 PAU2YEL049W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 PAU12YGR294W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
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