Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	DSE4	YNR067C	3354 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	MET6	YER091C	2304 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	RMD5	YDR255C	1266 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	THO1	YER063W	657 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	PEX18	YHR160C	852 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	RPC17	YJL011C	486 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	ATG27	YJL178C	816 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YLL037W	YLL037W	381 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YLR076C	YLR076C	423 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	REC102	YLR329W	795 nt		2.95	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	BCK1	YJL095W	4437 nt		2.94	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YBL005W-B	YBL005W-B	5268 nt		2.94	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	SRP68	YPL243W	1800 nt		2.94	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	SSY1	YDR160W	2559 nt		2.94	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	ATG11	YPR049C	3537 nt		2.94	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YHR032W-A	YHR032W-A	180 nt		2.94	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	ATP12	YJL180C	978 nt		2.94	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	TAF3	YPL011C	1062 nt		2.94	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	NUP170	YBL079W	4509 nt		2.94	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	MED1	YPR070W	1701 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	MIX14	YDR031W	366 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YDR222W	YDR222W	1248 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	IRC6	YFR043C	714 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	SCL1	YGL011C	759 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YHR213W	YHR213W	597 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YAR062W	YAR062W	597 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YNR062C	YNR062C	984 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YPL035C	YPL035C	348 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	KRE2	YDR483W	1329 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	RDS2	YPL133C	1341 nt		2.93	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	SLP1	YOR154W	1764 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	CTH1	YDR151C	978 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YDR491C	YDR491C	492 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	CAJ1	YER048C	1176 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YGR190C	YGR190C	366 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	AYR1	YIL124W	894 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YKL091C	YKL091C	933 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	SFH1	YLR321C	1281 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	PFK27	YOL136C	1194 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YJL132W	YJL132W	2253 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	GCD6	YDR211W	2139 nt		2.92	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	MPS1	YDL028C	2295 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	PLM2	YDR501W	1566 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	BEM4	YPL161C	1902 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YDL241W	YDL241W	372 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	NSE3	YDR288W	912 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	DYN2	YDR424C	279 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	PEX14	YGL153W	1026 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	GPI2	YPL076W	843 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	RPO41	YFL036W	4056 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	AI2	Q0055	2565 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	ATG13	YPR185W	2217 nt		2.91	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	YKL100C	YKL100C	1764 nt		2.9	□□□□□ -1.94
TY3A-G	Q12173	MED2	YDL005C	1296 nt		2.9	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		2.9	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YIL102C-A	YIL102C-A	228 nt		2.9	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YLR230W	YLR230W	306 nt		2.9	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YBL028C	YBL028C	321 nt		2.9	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	IAH1	YOR126C	717 nt		2.9	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	DGK1	YOR311C	873 nt		2.9	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	DIM1	YPL266W	957 nt		2.9	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	VPS9	YML097C	1356 nt		2.89	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	JIP3	YLR331C	378 nt		2.89	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		2.89	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YOL024W	YOL024W	519 nt		2.89	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	RPB8	YOR224C	441 nt		2.89	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	POL30	YBR088C	777 nt		2.89	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YBR116C	YBR116C	528 nt		2.89	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	ARA1	YBR149W	1035 nt		2.89	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YLR278C	YLR278C	4026 nt		2.89	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YJR061W	YJR061W	2808 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	CYR1	YJL005W	6081 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	BNI4	YNL233W	2679 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	MON1	YGL124C	1935 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YDL050C	YDL050C	372 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	RRP42	YDL111C	798 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YLR347W-A	YLR347W-A	141 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	AAR2	YBL074C	1068 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	DDI3	YNL335W	678 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	MPD2	YOL088C	834 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YPL107W	YPL107W	747 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	PKP2	YGL059W	1476 nt		2.88	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	RSM23	YGL129C	1353 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	ERG11	YHR007C	1593 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YCL019W	YCL019W	5313 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	SEC26	YDR238C	2922 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	KAP104	YBR017C	2757 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	RRG1	YDR065W	1098 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	VMA5	YKL080W	1179 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	ICY1	YMR195W	384 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	RPL20A	YMR242C	519 nt		2.87	□□□□□ -1.95
TY3A-G	Q12173	YSA1	YBR111C	696 nt		2.87	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms