Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YFL015CYFL015C 495 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YKL115CYKL115C 393 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 NBP1YLR457C 960 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YNL050CYNL050C 813 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 GCY1YOR120W 939 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 snR24snR24 89 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 CBP6YBR120C 489 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 snR35snR35 204 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 CDC37YDR168W 1521 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 ARP5YNL059C 2268 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 ERG9YHR190W 1335 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YLR352WYLR352W 2424 nt3.36□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 MDN1YLR106C 14733 nt3.36□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 UBC13YDR092W 462 nt3.36□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 DIG2YDR480W 972 nt3.36□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RPS23AYGR118W 438 nt3.36□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 VMA10YHR039C-A 345 nt3.36□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RPS23BYPR132W 438 nt3.36□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 PEX6YNL329C 3093 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 APM3YBR288C 1452 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 SIZ1YDR409W 2715 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YDR203WYDR203W 318 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YPR1YDR368W 939 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 VAB2YEL005C 849 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RPS8BYER102W 603 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YGL214WYGL214W 486 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 PEF1YGR058W 1008 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YHR180WYHR180W 492 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RPL13BYMR142C 600 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RPS8AYBL072C 603 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YOL107WYOL107W 1029 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 TIR2YOR010C 756 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 TUM1YOR251C 915 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 CMD1YBR109C 444 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 HBT1YDL223C 3141 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 POL4YCR014C 1749 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RAD18YCR066W 1464 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 SPA2YLL021W 4401 nt3.35□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 TAF1YGR274C 3201 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 SET1YHR119W 3243 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 MSH2YOL090W 2895 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YDR133CYDR133C 336 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 DOG2YHR043C 741 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YIL141WYIL141W 390 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 DAL2YIR029W 1032 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RCN1YKL159C 636 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 HHF2YNL030W 312 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RSM19YNR037C 276 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RPS7AYOR096W 573 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RXT2YBR095C 1293 nt3.34□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 MAK5YBR142W 2322 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 MUS81YDR386W 1899 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 PRP22YER013W 3438 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RPA14YDR156W 414 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 PEX10YDR265W 1014 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RTT105YER104W 627 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 LIN1YHR156C 1023 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YHR212CYHR212C 336 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 ANB1YJR047C 474 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YKL069WYKL069W 543 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 TPK3YKL166C 1197 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YAR060CYAR060C 336 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 snR189snR189 189 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RPC40YPR110C 1008 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 POP7YBR167C 423 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YCG1YDR325W 3108 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 AVT5YBL089W 1380 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 MYO5YMR109W 3660 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 ERT1YBR239C 1590 nt3.33□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 REG1YDR028C 3045 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 BSC1YDL037C 987 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 SLU7YDR088C 1149 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YGL109WYGL109W 324 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 SPT4YGR063C 309 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 PET54YGR222W 882 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 SOD1YJR104C 465 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RPL15AYLR029C 615 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 IMP1YMR150C 573 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 MPD2YOL088C 834 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YOR387CYOR387C 621 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RRP15YPR143W 753 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RNT1YMR239C 1416 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 PEX5YDR244W 1839 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 GYL1YMR192W 2163 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 TIF4631YGR162W 2859 nt3.32□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 ALA1YOR335C 2877 nt3.32□□□□□ -1.88
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