Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	SNU23	YDL098C	585 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	DTD1	YDL219W	453 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	PET100	YDR079W	336 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	PLP1	YDR183W	693 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	FMP32	YFL046W	624 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YGR160W	YGR160W	612 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	RSM19	YNR037C	276 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	MPD2	YOL088C	834 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	ARO4	YBR249C	1113 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	RIX1	YHR197W	2292 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	BEM4	YPL161C	1902 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	DIA2	YOR080W	2199 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	ECM18	YDR125C	1362 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	SPH1	YLR313C	1593 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YML096W	YML096W	1578 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	LRS4	YDR439W	1044 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	GRX2	YDR513W	432 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	MET14	YKL001C	609 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YBL028C	YBL028C	321 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	ECM13	YBL043W	774 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	ATG19	YOL082W	1248 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	FIG1	YBR040W	897 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	ERV15	YBR210W	429 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YLR001C	YLR001C	2589 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	MET6	YER091C	2304 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	ESC1	YMR219W	4977 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	GEA1	YJR031C	4227 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	HPA3	YEL066W	540 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YGR017W	YGR017W	894 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	VMA5	YKL080W	1179 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	INO4	YOL108C	456 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	PRM4	YPL156C	855 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	CTP1	YBR291C	900 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	NET1	YJL076W	3570 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	CWC22	YGR278W	1734 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	MED1	YPR070W	1701 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	SEC27	YGL137W	2670 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	THO1	YER063W	657 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	AST2	YER101C	1293 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	RPL14B	YHL001W	417 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	PAU13	YHL046C	363 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YNR062C	YNR062C	984 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	ILS1	YBL076C	3219 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	VPS30	YPL120W	1674 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	MRH1	YDR033W	963 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YDR491C	YDR491C	492 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YGL138C	YGL138C	1038 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YGL152C	YGL152C	678 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	EFG1	YGR271C-A	702 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	MMF1	YIL051C	438 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	RPL17B	YJL177W	555 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	VPS25	YJR102C	609 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	BOS1	YLR078C	735 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	ARP9	YMR033W	1404 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YMR099C	YMR099C	894 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YIP3	YNL044W	531 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	IRC13	YOR235W	315 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	RPL33A	YPL143W	324 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	CCL1	YPR025C	1182 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	YPR050C	YPR050C	414 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	AI4	Q0065	1671 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	ITT1	YML068W	1395 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	FAA2	YER015W	2235 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	VAC14	YLR386W	2643 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	MET5	YJR137C	4329 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VIK1	Q12045	SAD1	YFR005C	1347 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YKL222C	YKL222C	2118 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	HTA1	YDR225W	399 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	TDA10	YGR205W	873 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YJR056C	YJR056C	711 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YKR033C	YKR033C	426 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YOL038C-A	YOL038C-A	96 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	UFE1	YOR075W	1041 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	STE23	YLR389C	3084 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	POL3	YDL102W	3294 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	BUD26	YDR241W	288 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	GIC2	YDR309C	1152 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YFR010W-A	YFR010W-A	189 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YGL177W	YGL177W	348 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	HTD2	YHR067W	843 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	ATG27	YJL178C	816 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	MRPS8	YMR158W	468 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	INP1	YMR204C	1263 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	FYV6	YNL133C	522 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YBR013C	YBR013C	390 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	MCT1	YOR221C	1083 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	ICR1	ICR1	3199 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	ROG1	YGL144C	2058 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	HFM1	YGL251C	3564 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	TLC1	TLC1	1301 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	KAR1	YNL188W	1302 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	WHI3	YNL197C	1986 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	ECM11	YDR446W	909 nt		2.69	□□□□□ -1.98

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