Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CPSF1Q10570 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPSF1Q10570 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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