Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCBP1Q09161 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms