Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms