Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms