Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3AQ05086 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms