Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNEQ04844 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms