Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP7AQ04656 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms