Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A2Q01362 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms