Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN7AQ01118 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms