Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms