Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CLTCQ00610 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLTCQ00610 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms