Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK3Q00526 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK3Q00526 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK3Q00526 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK3Q00526 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms