Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP5P82980 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP5P82980 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP5P82980 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP5P82980 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP5P82980 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms