Protein–RNA interactions for Protein: P78527

PRKDC, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKDCP78527 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKDCP78527 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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