Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX3P78415 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX3P78415 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX3P78415 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms