Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP1P78357 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms