Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IP78347 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IP78347 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GTF2IP78347 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2IP78347 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms