Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM193AP78312 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms