Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA52P62987 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA52P62987 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA52P62987 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA52P62987 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA52P62987 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA52P62987 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA52P62987 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA52P62987 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA52P62987 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA52P62987 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA52P62987 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA52P62987 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA52P62987 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms