Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P62684 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms