Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNRPFP62306 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms