Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RPS29P62273 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RPS29P62273 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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