Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP46P62068 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP46P62068 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP46P62068 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP46P62068 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP46P62068 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP46P62068 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP46P62068 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP46P62068 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP46P62068 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP46P62068 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP46P62068 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP46P62068 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP46P62068 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP46P62068 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP46P62068 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms